Со времен образования и начала активной научной деятельности университетских ботанических садов, именно научно-образовательное направление позволяет говорить, что сад является ботаническим садом — научной организацией (Скворцов, 1996). В ботанических садах создаются не только коллекции живых растений, но и специализированные коллекции: банки семян, гербарии растений и растительных образцов, хранящихся при низких отрицательных температурах (криоколлекции) (Benson, 2002), коллекции in vitro (Новикова, 2013). Имеются и другие варианты ботанических коллекций, которые менее распространены и известны, например, сохранение растений в формалине, восстановленные растения. Большого распространения такие коллекции еще не получили, но, возможно, коллекции из восстановленных растений в будущем будут востребованы, как наиболее наглядные по сравнению с гербарными коллекциями.